Лечилка, к сожалению, не активирует лицензию, а лишь позволяет компилятору и отладчику (а также их dll-компонентам) ИГНОРИРОВАТЬ ОТСУТСТВИЕ лицензии. Поэтому LicenseManager и после лечения будет продолжать показывать, что лицензий нет.
   Поэтому при первом запуске IDE предупреждение об отсутствии лицензии появляется у всех, т.к. сама IDE живет в другом директории (common) и не модифицируется лечилкой. Однако в этом и нет необходимости, т.к. в том выскакивающем диалоге, который просит активацию, есть в самом низу галочка (checkbox), позволяющая при последующих запусках это предупреждение не показывать. Называется так: "Don't run the Wizard for this product at startup". Поставьте там галочку, и IDE при запуске не станет больше вам докучать.